核酸は深く突けば突くほど正確というわけではない。 核酸検査は一般的に咽頭ぬぐい液で行われるが、採取部位は咽頭であり、咽頭や扁桃の分泌物を採取して検査を行う必要がある。 咽頭と扁桃が核酸採取の主な採取ポイントであり、検査は被験者に頭を後ろに傾けてもらい、口を大きく開けてもらうことから始める。 サンプラーは綿棒で舌根から咽頭後壁、扁桃陰窩、側壁などを横切る。3～5回繰り返し拭いて粘膜細胞を採取し、採取終了後、綿棒を試験管に挿入し、しっかりと詰めてから適時検査に回す。 核酸検査中は交差感染を避けるため医療用マスクを着用し、サンプリング後は直ちに退出する。 発熱や頭痛などの症状が出た場合は、すぐに発熱外来を受診する。