腕間の染色体逆位は、染色体異常や発育構造異常を持つ胎児に影響を及ぼす可能性があります。 非侵襲的な出生前検査や妊娠中の出生前診断で染色体逆位（7番または9番、Y染色体など）が示唆された場合、染色体異常や先天性心疾患などの胎児の先天性構造異常が重なる可能性があります。 長期的な影響としては、女性胎児の生殖期間中の不妊や反復流産、男性胎児の女性胎児の不妊などがあります。 スクリーニングによって染色体構造異常が発見されるリスクが高い人や、重度の先天性異常児を出産するカップルに対しては、適時出生前カウンセリングと出生前診断を妊娠後に実施し、胎児の染色体異常のリスクを除外すべきである。 不利な妊娠・出産を繰り返した経験のあるカップルには、必要であれば、医学的監視の下で第3世代の体外受精-胚移植（IVF-ET）を行い、妊娠させることができる。