タンパク質の消化率に影響を与える要因には、タンパク質の種類、加工方法、その他の成分が含まれる。
1.タンパク質の種類：供給源の異なるタンパク質の消化率には大きな差があり、ほとんどの場合、動物性タンパク質の消化率は植物性タンパク質よりも高い。 また、ソルガムきびの粉とソルガムきびの乳胚のように、同じ種類のタンパク質の消化率でも部位によって違いがある。
2.加工方法：食品の加工方法の違いは、タンパク質の消化率に影響を与える。例えば、強火で煮ることはタンパク質の消化率を下げ、弱火で蒸すことは消化率が高くなる。 食品の押し出しやパフは、ジスルフィド結合を破壊することでタンパク質の消化率を高める。
3.その他の成分：一部の食品には、フェノール、フィチン酸など、タンパク質の消化率に影響を与える物質が含まれており、これがタンパク質の消化率を低下させる。