ピロリ菌の除菌には4剤併用療法が最も効果的である。
現在、経験的なピロリ除菌レジメンとして推奨されているのはビスマス4剤併用療法である。 例えば、古典的なビスマス4剤併用療法は、プロトンポンプ阻害薬、ビスマス、アモキシシリン、クラリスロマイシンからなる。
1回目の除菌治療に失敗した患者には、6ヵ月後に残りの治療法の中から別の治療法を選択し、複数の抗生物質に耐性のある患者には、治療前に薬剤感受性試験を行って感受性の高い抗生物質を選択し、繰り返し治療に失敗し、治療を継続する必要がある患者には、医師が患者を個別に総合的に評価します。
一般的に、ピロリ菌感染症は医師の指導の下、標準化されたピロリ菌除菌のための薬物療法によって完治しますが、食事衛生や生活習慣に注意を払わないと再感染する可能性があります。