低身長の原因は下表のようにたくさんありますが.臨床的に多いのは次の4つです。1. 遺伝的・家族的要因 家族の中に低身長の人がいれば.その次の世代は小人症になりやすいと言われています。しかし.遺伝的な要因は.その後の成長において環境要因の影響を受けることもあります。
2.低出生体重・低身長であること。出生時の体重が正常出生体重（通常2.5kg）より少ない場合.それが未熟児であっても完熟児であっても.そのほとんどは.すべての年齢.最終成人期において.正常出生体重・身長の人よりも身長が低くなります。
3.栄養と病気：妊娠中の母親の栄養は.母親が妊娠中に重度の栄養失調を持っているか.慢性的な心臓.肺.肝臓.腎臓疾患に苦しんでいる場合.胎児の成長障害.胎児期の子供を作り.出生後の高さが通常よりも低いことがあります胎児の成長に不可欠である。
4.いくつかの内分泌疾患：例えば.出生後の身長の伸びに密接に関連している成長ホルモンは.成長ホルモンの不足がある場合.子供の低身長を引き起こす可能性があり.別の例では.体の代謝を調節することができますチロキシンです。