原発性肝癌患者の約70％はα-フェトプロテインが陽性であり.残りの30％の肝癌患者については.他の肝癌マーカーも肝癌の診断に用いることができる。 その他の肝癌マーカーとしては.1.G-グルタミルトランスペプチダーゼアイソエンザイムII G-グルタミルトランスペプチダーゼは.アミノ酸の代謝に深く関わる肝臓に存在する酵素系で.ポリアクリルアミド電気泳動で10種類以上に分類される。 原発性肝癌では.アイソザイムI’.アイソザイムII.アイソザイムII’が有意に上昇し.これらのアイソザイムは肝癌に特異的で.他の種々の肝疾患では上昇しないことが確認された。 プロトロンビンゲン異常 プロトロンビンとは.肝臓で合成される血液凝固に関係する物質です。 肝細胞癌細胞は.構造的に正常なプロトロンビンのようにグルタミン酸残基でカルボキシル化されておらず.機能的にも正常な凝固系で活性化されない異常プロトロンビン（DCPと略記）を産生することがあります。 したがって.肝炎や肝硬変の患者さんの血清中にも検出されるが.肝細胞癌の患者さんに比べてはるかに低いレベルである。 そのため.血液中に一定量の異常なプロトロンビンが検出されると.肝臓がんの診断に役立つことがあります。 その他.肝がんのマーカーとして.? -ガラクトシダーゼと酸性フェリチンは肝癌の診断に有用であるが.これらの肝癌マーカーはα-フェトプロテイン.G-グルタミルトランスペプチダーゼアイソエンザイムII.プロトロンビン異常と同様に特異度.感度が低く臨床的に有用とはいえない。