咳の原因は.多くの複雑な要因が組み合わさった結果であることが多く.主なものは以下の通りである：
1.吸入物質
吸入物質は.特異的なものと非特異的なものの2種類に分けられる。 前者はダニ.花粉.煙.真菌.動物の毛などであり.非特異的吸入物質は硫酸.二酸化硫黄.クロラミンなどである。 職業性咳嗽の特異的吸入物質としては.トルエンジイソシアネート.無水フタル酸.エチレンジアミン.ペニシリン.プロテアーゼ.アミラーゼ.絹.動物のふけや排泄物などがある。
2.感染症
咳の形成と発症は.再発性の口笛感染と関連している。 咳のある患者では.細菌.ウイルス.マイコプラズマなどに対する特異的IgEが存在することがあり.対応する抗原を吸入すると咳を誘発することがある。 ウイルス感染後.口笛の上皮に直接損傷が起こり.口笛の反応性が亢進することがある。 好塩基球からのヒスタミン放出は.ウイルス感染によって産生されるインターフェロンやIL-1によって増加すると考えられている。 授乳期には.口笛ウイルス（特に口笛合胞体ウイルス）感染後の咳症状の発生率も高い。 回虫や鉤虫などの寄生虫による咳は.衛生状態の悪い地域で見られることがある。
3.食物
食事による咳発作は.咳のある人.特に食物アレルギーを起こしやすい乳幼児や小児によく見られるが.年齢とともに減少する。 アレルギーを引き起こす最も一般的な食品は.魚.エビ.カニ.卵.牛乳である。
4.気候の変化
気温.気圧.空気中のイオンの変化によって咳が誘発されることがあるので.気候が変化する寒い季節や秋から冬にかけて多くなる。
5.精神的要因
感情的なストレスや緊張.怒りなどが咳の引き金になることがあり.一般的には大脳皮質や迷走神経反射.過呼吸などが原因と考えられている。
6.運動
70～80％の咳嗽患者が激しい運動後に誘発される咳嗽を有し.運動誘発性咳嗽または運動咳嗽と呼ばれる。 臨床症状としては.咳.胸部圧迫感.息切れ.喘鳴があり.聴診ではクループが聞こえることもある。 運動後に典型的な喘息症状はないが.運動前後の肺機能測定で気管支攣縮が検出される患者もいる。
7.咳と薬物
一部の薬物は咳のエピソードを引き起こすことがあり.例えばトレチノインのようなβ2アドレナリン受容体をブロックすることによって引き起こされる咳がある。
喫煙が健康に有害であることは常識であり.喫煙には4つの具体的な危険性がある：
まず.タバコの霧に含まれる一酸化炭素とニコチンは.組織や心筋を低酸素状態にし.冠状動脈の痙攣を誘発し.血液の粘度を高め.脂質代謝を妨げ.コレステロール様物質の沈着を促進する。
第二に.動脈壁の正常な機能を維持できる内皮細胞に損傷を与える作用があり.心拍数と心拍出量を増加させ.血管収縮により血圧を上昇させることもあり.いずれも心臓の負担を増加させ.長期間の喫煙は冠動脈の血管拡張を低下させ.血小板凝集を増加させ.血液中のフィブリノーゲンを増加させ.冠動脈粥腫斑の形成を招き.悪化させる。
第三に.喫煙は血中脂質の組成を変化させ.HDLの減少とLDLの増加.血清抗酸化物質の減少を引き起こし.動脈硬化と冠動脈性心疾患の発症と発展を促進する。
第四に.一部の若い患者にとって.過度の喫煙は急性心筋梗塞発症の重要な要因である。
第五に.喫煙者の冠動脈性心疾患のリスクは非喫煙者の約2.2倍であり.喫煙は心臓病を発症する可能性を2倍以上にするという研究結果がある。 したがって.冠動脈性心疾患のある人は禁煙を決意しなければならない。