便中のグラム陽性菌の割合は通常30％であり、陽性菌には球菌と桿菌があるが、グラム陽性桿菌の割合が15％であれば通常正常である。 グラム陽性桿菌の割合が30％以上であれば、腸内細菌叢異常の可能性がある。 腸内細菌叢異常症は、年齢、環境、食事、薬物、感染症などが関係し、下痢、腹痛、腹部膨満感、食欲不振などの症状がみられます。 急性腸炎、腸の手術後、慢性大腸炎、腸重積、糖尿病などでよくみられます。 腸内細菌異常症の治療は、主にビフィズス菌、乳酸菌、枯草菌などのプロバイオティクスの外因性補充である。 プロバイオティクスの補充に加え、下痢症患者にはモンテルカスト、ジフェノクマロールなどの止瀉剤を、細菌感染症にはノルフロキサシン、レボフロキサシンなどの抗生物質を併用するなど、アロパシー治療や対症療法を行う必要がある。 15パーセントのグラム陽性桿菌については、診察の際に臨床症状とその他の補助的な検査を組み合わせて、医師が明確な診断を下すことが推奨される。