男性不妊の複雑な病因は.大きく分けて「精巣前因子」「精巣因子」「精巣後因子」の3つに分けられる。 (a) 精巣前因子：内分泌性不妊症（性腺機能低下症.5ą-還元酵素欠損症）.全身性疾患（グルココルチコイド過剰症やクッシング症候群.栄養不足.肥満症など）。 (ii) 精巣の要因：1.染色体異常（例：クラインフェッター症候群.Y染色体微小欠失.繊毛不動症候群.両側血管管異形成または無茎症.アンドロゲン受容体変異）.2.先天または発達異常（例：隠頭症.セルトリ細胞のみ症候群）.後天性疾患（精索静脈瘤.ウイルス性睾丸炎.環境毒性）.。 性行為による精巣の損傷：（電離放射線.重金属.高温.喫煙.アルコール依存症）.全身疾患（肝硬変.慢性腎不全）。 (iii) 精巣後因子：梗塞性無精子症.精巣上体壊死症.泌尿器感染症.勃起不全.射精不全.性交異常.免疫性不妊（抗精子抗体）。