HIV患者の肺炎は必ずしも進行しているとは限らず.どのような肺炎か.まれな病原体によるものかによって異なる。 患者の免疫機能.例えばCD4+ T-リンパ球数も評価する必要がある。 CD4+ T-リンパ球数が正常に近い場合は.病状は進行していない。 もしCD4+ T-リンパ球数が200mm^3未満に著しく低下していれば.AIDSの進行期である。 この時.適時に抗感染治療を行い.具体的な状況に応じて適切な抗ウイルス薬を選択することで.患者の免疫機能を回復させ.HIVウイルスの複製を阻害することでCD4+ T-リンパ球数を徐々に増加させることができる。