二妙散の明確な副作用や禁忌は報告されていない。
二妙散は黄柏と蒼朮からなる漢方処方で、清熱利湿（熱を取り除き、湿を乾燥させる）の効能があり、主に湿熱浸潤（腸、膀胱、陰部、下肢に湿と熱が侵入すること）による筋骨格系の痛み、足や膝の発赤、腫れ、痛み、湿熱帯下（湿熱の帯下、下半身に湿熱によるただれや湿疹ができること）、短小紅尿（濃い黄色の少量の尿が出ること）などに用いられる。
二苓散を服用している間は、アルコールを摂取してはならず、辛いもの、生もの、冷たいものを摂取してはならない。 医薬品は、専門的な漢方医の指導のもとでエビデンスを見極め、やみくもに自己判断で使用するのではなく、副作用を引き起こさないように使用する必要がある。