10年以上の食道炎は治療が非常に難しく、現在の臨床治療には主に一般治療、薬物治療、外科治療があるが、具体的な効果は人によって異なる。
1.一般治療：禁煙、アルコール制限、規則正しい労働と休養、感情的な過剰反応を防ぐための良好な精神状態の維持など、生活習慣や食習慣の改善を含む。 長期的な病気の回復に重要である。
2.薬物治療：逆流性食道炎ではパントプラゾールなどのプロトンポンプ阻害薬、炭酸アルミニウムマグネシウムなどの胃粘膜保護薬、ドンペリドンなどの消化管刺激薬が、感染性食道炎ではフルチカゾンプロピオン酸エステルなどのグルココルチコイド、クラリスロマイシンなどの抗生物質、アシクロビルなどの抗ウイルス薬がよく使用される。
3.外科的治療：重度の逆流に対しては腹腔鏡下噴門形成術、食道狭窄に対しては食道拡張術、重度の食道びらんに対しては食道部分切除術が選択される。
なお、食道炎は長期にわたる疾患であり、上記の各方法の有効性は、個人の体調やアドヒアランス、基礎疾患、治療時期や治療計画などさまざまな要因に影響される可能性がある。
食道炎と診断された患者は、医師の指導の下で、実際の状況に応じて治療法を選択・調整しなければならない。