HLA-B27陽性は必ずしも強直性脊椎炎を意味するものではなく、健常人の10％にも認められる。 HLA-B27はヒト白血球抗原の一つであり、強直性脊椎炎での陽性率は約90％、反応性関節炎、乾癬性関節炎などでもみられ、正常集団でも10％の陽性率がある。 したがって、HLA-B27陽性は臨床医にとって強直性脊椎炎を診断する手がかりにしかならない。 強直性脊椎炎の診断には、専門医が患者の状態、病歴、症状、補助的検査を分析し、他の可能性のある疾患を徐々に除外してから確定診断を下す必要があるが、その際、X線検査は、仙腸関節病変が見つかれば、疾患の確定診断の重要な根拠となる。 HLA-B27の検査結果が陽性であった患者には、通常の病院のリウマチ・免疫科を受診することが勧められる。