高血圧、肥大型心筋症、大動脈弁狭窄症は心室中隔肥厚の原因となり、呼吸困難、腹水、めまい、疲労、胸痛などの症状を引き起こすことがある。 軽度の心室中隔肥厚は無症状のこともあるが、原疾患に関連した症状を呈することもある。 例えば、高血圧に関連した症状（めまい、脱力感、目のかすみなど）、肥大型心筋症の症状（胸痛、呼吸困難、動悸、失神など）、大動脈弁狭窄症の症状（胸痛、パニック発作、活動後の息切れなど）などがある。 心室間隔の肥厚が続くと、心臓からの血液の流出路が閉塞し、末梢に排出される血液量が減少し、心室内の圧力が上昇するため、呼吸困難、肝脾腫、腹水、下肢の浮腫などの症状が現れます。 このような症状が現れたら、早めに病院に行くことをお勧めします。