慢性腸炎は中国伝統医学（中医学）の「腹痛」と「下痢」に属し、内服薬、浣腸、鍼灸などで治療する。 1.中医学による慢性腸炎の治療は、その証を明らかにし、適切な治療を選択する必要がある。 漢方医は慢性腸炎を脾虚、肝気が脾を増長、脾腎陽虚（脾腎の陽気不足）、瘀血閉塞などの証型に分類することが多い。 臨床でよく使われる処方は、痛性下痢精華、川苓白朮散、諸葛丸などである。 2.漢方薬による内服治療は、症状に応じて漢方薬の煎じ薬や外浣を併用することもできる。 3.医師の指導の下で、鍼灸、合谷、上腹部、天柱、足三里のツボを併用し、脾臓を強化すると同時に下痢を止め、総合的な治療の効果を調整するのがよい。 慢性腸炎の食事は、辛いもの、刺激物、冷たいもの、硬いものを避けるべきである。 それぞれの病態に応じて、専門の漢方医の指導の下、適切な治療計画法を選択し、治療後は定期的に経過観察を行う。