ワクチンとは、病原体から身体を守る有効な抗体を産生するよう、身体を刺激するものである。 ウイルスとは、身体に感染して病気を引き起こす病原体である。 具体的な違いは以下の通りである：
ワクチンとは、細菌、ウイルス、およびそれらの代謝産物などの病原微生物を人為的に弱毒化、不活化、遺伝子組換えなどした感染症予防のための自己免疫薬である。 生体がこのような病原性のない細菌にさらされると、免疫系はある種の防御物質を産生する。
ウイルスは最も小さく、最も単純な構造を持つ微生物であり、ヒトの様々な病気を引き起こす。 ウイルス感染によって引き起こされる一般的な病気には、肝炎、インフルエンザ、脳炎、腎症候群を伴う出血熱、水痘、麻疹などがある。