ペストの治療には通常10～20日かかり、その間は厳重に隔離する必要がある。 これに加えて、回復には7日間の経過観察と6回の喀痰培養陰性が必要である。 ペストの主な種類は腺ペスト、肺ペスト、敗血症性ペスト、軽症ペストなどであり、主にストレプトマイシンで治療し、治療期間は10～20日程度で、重症例はより長い期間が必要である。ストレプトマイシンがアレルギーの場合は、アミノグリコシド系、フルオロキノロン系などの治療薬も使用可能であり、医師の指示に従って薬剤を選択し、違和感があれば適時検査し、治療薬を交換する。 治療期間中は厳重な安静を保ち、ネズミやノミのいない環境に隔離し、定期的に消毒を行う。 一方、腺ペストの患者はリンパ節腫大が完全に消退するまで隔離し、その後7日間観察し、肺ペストの患者は喀痰培養が6回陰性であることが必要である。 集団は一般的にペストに感染しやすく、ペストに感染していることが判明した場合、ネズミとノミの厳重な駆除、隔離と観察と治療、個人防護の強化、ペストに対する予防ワクチン接種との密接な接触を行う。